«Рубашка» комондора уникальна, напоминает овечье руно. Мягкий подшерсток сочетается с длинными грубыми волнистыми или курчавыми покрывным волосом, за свет чего образуются прочные войлокообразые шнуры.

До 6-9 месяцев комондор равномерно покрыт шерстью одинаковой длины. Затем шерсть, если ее не разбирать на шнуры, начинается сваливаться в войлок в виде лепешек. Разобранная шерсть имеет форму шнуров 20-27 см. на спине, боках и крупе, 10-18 см. на голове, 9-11 см. на губах и лапах.

При правильном уходе шнуры отрастают до земли. Линяют эти собаки только в отдельных случаях, например суки во время беременности.